No final do ano 2000, os fazedores de teatro da cidade de Joinville sentiram a necessidade de juntar-se num movimento que permitisse o encontro, a reflexão e uma maior visibilidade dos trabalhos desenvolvidos pelos grupos locais. Surge então, a partir desta necessidade, o Fórum Permanente de Teatro, que pretendia servir como espaço de reflexão e canal representativo do movimento teatral junto ao poder público e as demais instâncias da sociedade.
Após um ano de funcionamento este Fórum resolveu constituir-se num órgão representativo oficial, criando a ASSOCIAÇÃO JOINVILENSE DE TEATRO em 2001. Teve como primeiro presidente Ilaine Melo, do grupo Unicórnio. Para instalar oficialmente esta associação com ações concretas, o movimento entendeu ser fundamental ainda em 2001 -  denominado ano do teatro pelo governo de Joinville - organizar uma mostra pensada e realizada pelos membros da associação. Para isso, através de contatos com a Fundação Cultural, começou a utilizar o Espaço Cultural Antarctica, e para tal, solicitou o equipamento mínimo para que fosse possível a sua ocupação com conforto, tanto para os grupos como para o público que para lá passou a se dirigir.
O Galpão de Teatro da Antarctica, centro das atividades da AJOTE, teve forte programação cultural no ano de 2006, além de servir de local de ensaio para os grupos associados. Com 98 apresentações no ano de 2006, só no galpão, através da gestão da AJOTE, o público atingido foi de mais de 7.000 pessoas.
 Já em 2007, os ensaios, apresentações e oficinas continuam no galpão de teatro. A AJOTE conta atualmente com 11 grupos associados: Dionisos Teatro, La Trama, Em Cena, Soar, Metamorfose, Atos, Ubaia, Pixilanga, Bando Néon, GT Belas Artes e Cia Joinvilense de Teatro.